Ubicadas en la región árida que el comandante Stephen Long describió en 1820 como "El gran desierto americano", las tierras agrícolas del valle de Little Thompson requerían riego regular en verano para cultivar.

James Eaglin se convirtió en el primer agricultor del valle en 1866 cuando plantó trigo en su granja recién reclamada en el fondo del río Little Thompson. Cuando Eaglin solicitó derechos de agua del río en 1869, sentó las bases para el sistema de “compañías de acequias” organizadas que continúan recolectando agua del río durante la escorrentía de primavera y almacenándola para riego en los meses secos del verano.

Si bien el trigo fue el primer cultivo que se cultivó en el valle de Little Thompson, la alfalfa se convirtió en un cultivo importante en la década de 1890, cuando se descubrió que podía usarse como alimento para engordar ovejas de manera rentable. En 1905, cuando los agricultores de la zona enviaron más de 63.000 corderos al mercado, Berthoud se había convertido en un bullicioso centro agrícola del condado de Larimer que era bien conocido por sus prósperos agricultores.

Esa prosperidad se vio reforzada a principios del siglo XX cuando la Great Western Sugar Company introdujo la remolacha azucarera en el norte de Colorado y construyó ferrocarriles y fábricas para desarrollar la industria. Los productores de Berthoud entregaron remolachas a varios vertederos rurales donde las remolachas se cargaron en vagones y se transportaron a fábricas de azúcar en las cercanas Loveland y Longmont.

La agricultura continúa contribuyendo al patrimonio del valle de Little Thompson a pesar de que la urbanización gradual ha disminuido en gran medida la disponibilidad de agua y tierras agrícolas.

Después de que Berthoud se mudó de su ubicación original en el fondo del río Little Thompson a su sitio actual en el invierno de 1883-84, la ciudad comenzó a convertirse en un bullicioso centro agrícola del sur del condado de Larimer. Los primeros negocios de la ciudad, construidos a partir de los servicios requeridos por los agricultores de las áreas rurales periféricas, estaban ubicados en un distrito comercial de tres cuadras que se extendía a ambos lados de las vías del ferrocarril Colorado y Southern.

En 1900, cuando Berthoud se estableció firmemente en su nueva ubicación, el periódico local enumeró los negocios de la ciudad como: "Dos grandes almacenes, dos almacenes generales, dos farmacias, dos tiendas de novedades, dos restaurantes y panaderías, dos graneros, una tienda de implementos, una joyería, una sombrerería, un mercado de carne, un almacén de madera, una oficina de periódicos e imprenta, una talabartería, una barbería, un banco, un taller de reparación de máquinas, tres médicos, dos dentistas, dos carpinterías, una tienda de alimentación "Un molino, dos talleres de pintura, un yesero, tres herrerías, un gran hotel, una escuela primaria, tres iglesias, siete organizaciones fraternales, una empresa de molinos y ascensores, un taller de reparación y arranque de botas".

El artículo del periódico califica a Berthoud como una “ciudad viva” con todos los servicios necesarios para el crecimiento y desarrollo de la ciudad y de la comunidad agrícola circundante.

La Ley de Homestead de 1862 trajo la primera ola de colonos al valle de Little Thompson a finales de la década de 1860. James Eaglin pagó $10 para presentar una patente sobre una propiedad de 160 acres en 1866 y fue el primero en “probarlo” al permanecer durante los cinco años requeridos. Otros que les siguieron renunciaron rápidamente a sus derechos, pero a medida que la década de 1880 llegaba a su fin, el valle se llenó de familias pioneras que habían tallado granjas productivas en la pradera cruda.

Lewis Cross, que llegó al territorio de Colorado en 1860, se convirtió en el padre de la comunidad cuando reclamó uno de los primeros derechos de propiedad a orillas del río Little Thompson en 1873. Al otro lado del arroyo desde su vivienda, Cross construyó un pequeño tronco cabaña que sirvió como primera escuela e iglesia de la comunidad y ancló un pequeño asentamiento que se convirtió en el punto de envío del trigo de los agricultores.

Cuando los funcionarios del ferrocarril solicitaron que el asentamiento en la granja Cross se reubicara desde el fondo del río a un terreno más alto, el pequeño burgo se trasladó una corta distancia al norte a un nuevo sitio de la ciudad ubicado en la granja de Peter Turner.

Entre los primeros colonos del valle de Little Thompson se encontraban Patrick Burnside, Carey Culver, WR Blore, Charles Meining, Stephen Preffer, SS Osborn, Simon Bennett, Davis Baxter, CV Stryker, James Bradley, Chalmon Wray, CR Skinner, William Flora, Mary Cole, CC Clark, Abner Sanderson, WH McCormick, Andy Fairbairn, HK Hankins, AA Knott, JH Welty, Fred Bein, OJ Smith, Phebe Knapp, CFW Beeler, James Taylor y George Wilson.

Las abundantes cosechas de trigo en el valle de Little Thompson llevaron al empresario de Denver JK Mullen de Colorado Milling & Elevator Company a construir un elevador de granos en Berthoud en el otoño de 1885. Dos años más tarde, en el invierno de 1887-88, cuando Berthoud Farmers Milling & Elevator Se constituyó la empresa, se compró el ascensor a Mullen con planes de agregar un molino harinero.

Terminado en el otoño de 1888 a un costo de $52,000, el nuevo molino producía harinas de las marcas Crown Patent, Farmers Pride, Extra Fancy y Blue Ribbon a razón de 300 sacos por día. Para satisfacer la demanda, la fábrica funcionó las 24 horas del día hasta que se almacenaron entre 10 y 12 vagones llenos de barriles, cajas o sacos llenos de harina.

Recomprado por JK Mullen en 1903, el molino harinero fue la única fábrica de la ciudad desde la década de 1880 hasta la de 1940. El molino que estaba ubicado al este de las vías del ferrocarril en Berthoud's Mountain Avenue fue arrasado en 1966 después de que fuera declarado peligro de incendio local.

Berthoud toma su nombre del capitán Edward. L. Berthoud (1828-1898), quien inspeccionó la ruta del Ferrocarril Central de Colorado a través del valle de Little Thompson y el norte de Colorado. Berthoud Pass en la División Continental al oeste de Denver también toma su nombre del ingeniero nacido en Suiza que estuvo en la primera facultad de la Escuela de Minas de Colorado en 1872.

Floyd Clymer (1895-1970), de once años, fue anunciado como el “agente de automóviles para niños” cuando comenzó a vender automóviles Reo en Berthoud en 1906. Clymer, un conductor atrevido, intentó escalar Longs Peak en una motocicleta cuando era joven. Clymer se convirtió en uno de los primeros historiadores de los automóviles estadounidenses primitivos y construyó un imperio editorial basado en revistas y manuales de automóviles.

Peter Turner (1838-1912) fundó Berthoud en su sitio actual después de llegar al valle de Little Thompson desde el campamento minero Sunshine en 1877. Conocido cariñosamente por los residentes locales como "Tío Peter", Turner supervisó la perforación de un túnel que trajo agua desde el río Big Thompson hasta el valle de Little Thompson a través de Handy Ditch en 1883.

Las primeras vías colocadas a través del valle de Little Thompson en 1877 ayudaron al Ferrocarril Central de Colorado a conectar su línea entre Longmont, Colorado y Cheyenne, Wyoming. En el asentamiento de Berthoud en el fondo del río Little Thompson, la compañía construyó una casa para su equipo de sección y descarriló un vagón para que sirviera como depósito improvisado.

Cuando se descubrió que las locomotoras tenían dificultades para generar energía para ascender desde el fondo del río, los funcionarios hicieron saber que el pueblo sería trasladado a un terreno más alto o el tren ya no se detendría en el área. Para dar cabida al ferrocarril, la ciudad se trasladó en el invierno de 1883-84.

En el nuevo sitio de la ciudad, los apartaderos ferroviarios se ramificaban hacia elevadores de granos y un molino harinero que anclaba un distrito comercial del centro servido por trenes de pasajeros y de carga operados por Colorado & Southern Railroad.

Berthoud mantuvo una relación conflictiva con el ferrocarril que salió a la luz en 1905 cuando el tabloide local se quejó: “Parece casi una pérdida de tiempo decir algo sobre el estado de la sala de espera del depósito en Berthoud. Es una vergüenza para el pueblo. El Ferrocarril C. & S. le debe a esta comunidad proporcionar alojamiento cómodo para sus clientes, pero tal como están las cosas no hay suficiente espacio para alojar a más de media docena de personas. Las mujeres que tienen la mala suerte de tener que esperar en un tren no podrán entrar en la sucia sala de espera prevista para el público. Se ven obligados a esperar en las tiendas cercanas hasta que avistan el tren y luego correr hacia él. Es tan raro que un tren de C. & S. llegue a tiempo que se necesita una sala de espera decente”.

El servicio de pasajeros continuó hasta la década de 1940, pero dio paso a los trenes de carga operados por Burlington Northern y Santa Fe (BSNF Railway) que continúan utilizando el ferrocarril en la actualidad.

El primer camino de carretas a través del valle de Little Thompson se estableció en 1850 cuando un grupo de indios Cherokee que viajaban desde el noreste de Oklahoma hasta los campos de oro de California cruzaron los tramos superiores del valle de Little Thompson. Dirigido por el capitán Edmonson, guiado por el montañés Ben Simon y narrado por el cronista James Mitchell, el "grupo acampó en el borde de las montañas en un pequeño arroyo que corre hacia el este, el agua fría por la nieve".

Doce años más tarde, en 1862, Ben Holladay alteró la ruta de su línea Overland Stage para ir hacia el norte desde Denver hasta Laramie. El resultado fue un camino de diligencias que era aproximadamente paralelo al sendero que siguió el grupo Cherokee en 1850, pero ubicado a unas pocas millas al este en las cercanías de la actual Carretera Estatal 287 de Colorado. Holladay también estableció una "estación alternativa" en las orillas del Little Río Thompson, donde las diligencias se detenían para cambiar los equipos de caballos.

En 1937, los Pioneros de Little Thompson, un grupo que se describe a sí mismo como “hombres y mujeres que abrieron caminos”, colocaron un marcador de granito en la autopista 287 al suroeste de Berthoud para marcar las proximidades del cruce de la carretera Overland Stage del arroyo Little Thompson. Posteriormente, el monumento fue trasladado al parque de la ciudad de Berthoud, donde aún se encuentra.

En 1914, la autopista Lincoln seguía un corredor a través del norte de Colorado similar al del Overland Trail. Al cruzar el arroyo Little Thompson cerca del vado del antiguo cruce de la carretera, The Berthoud Bulletin opinó: “La autopista Lincoln no tiene actualmente ningún crédito para el caballero que le dio nombre. La gente que viaja allí durante la semana no está en condiciones de ir a la iglesia el domingo”.

Originalmente hogar de bandas nómadas de Arapaho, el valle del río Little Thompson se convirtió en el dominio del hombre blanco en la década de 1860, cuando los recién llegados al territorio de Colorado desviaron su atención de los distritos mineros cercanos a las propiedades a lo largo del río.

Entre estos primeros colonos se encontraba Lewis Cross, quien se convirtió en director de correos de la oficina de correos de "Little Thompson" en 1875. En 1877, cuando el Ferrocarril Central de Colorado tendió vías a través del río Little Thompson y al lado del rancho Cross, el pequeño asentamiento en la granja de Cross conocido informalmente como Little Thompson fue nombrado Berthoud en honor al Capitán EL Berthoud, quien había inspeccionado la ruta ferroviaria a través de la región.

Berthoud permaneció en su ubicación en el fondo del río hasta que la compañía ferroviaria solicitó que la ciudad fuera trasladada al acantilado al norte, donde el colono Peter Turner había planeado un nuevo sitio para la ciudad. Cuando la ciudad fue reubicada en el invierno de 1883-84, tomó consigo el nombre de Berthoud y el asentamiento original pasó a ser conocido como "Old Berthoud".

En su nueva ubicación, Berthoud comenzó a convertirse en un animado centro agrícola del sur del condado de Larimer. En unos pocos años, la ciudad se extendía por tres cuadras a lo largo de las vías del ferrocarril y contaba con un pequeño distrito comercial, un molino harinero y vecindarios residenciales que albergaban a 200 residentes.